[Бестия]

Vasex, поражающий эффект ЭМИ зависит от материала, из которого исполнен корабль. Находящимся внутри металлического корабля киборгам электромагнитные возмущения будут глубоко фиолетовы. А вот если заставить их выполнить корабль из чего-нибудь этакого... (как вариант - супер-пупер кевлар в несколько слоев, карбон или мегакрепкие полимеры) тогда тем, кто внутри будет ой как нехорошо. Для пущего эффекта можно выполнить несущие конструкции корпуса корабля из металла, превратив его в один большой резонатор. Только надо подвести под это какое-нить обоснование там в духе стоимости или еще чего.

Что касаемо ощущений, то у людей возможны головные боли, сердечная недостаточность и шалости с давлением - в будущем к космонавтам, возможно, не будут предъявлять такие требования по здоровью как сейчас, тем более такие неприятности характерны при активных выбросах даже на матушке Земле у более или менее здоровых людей. Неизвестно, что сотворит в разы увеличенная мощность излучения за минусом защитных свойств атмосферы. Что касаемо киборгов, то я бы предположила наличие фантомных болей на месте вышедших из строя элементов.

Из средств защиты это предохранители, дублированные цепи управления, выпрямители и включающиеся в цепь при необходимости резисторы. Из менее твердой НФ можно предположить наличие генераторов силового (электромагнитного) поля для работы в противофазе к ЭМИ.